A Molecular Phylogenetic Study of the Tribe Corallineae (Corallinales, Rhodophyta) with an Assessment of Genus‐Level Taxonomic Features and Descriptions of Novel Genera
Notice bibliographique
Résumé
A multigene phylogeny using COI-5P (mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1), psbA (PSII reaction center protein D1), and EF2 (elongation factor 2) sequence data for members of the tribe Corallineae was constructed to assess generic boundaries. We determined that traditional reliance on conceptacle position as an indicator of generic affinities in the Corallineae is not supported and taxonomic changes are required. We found that species currently assigned to Pseudolithophyllum muricatum resolved within the Corallineae in all analyses. This is the first record of crustose members in the subfamily Corallinoideae. Further-more, the genus Serraticardia was polyphyletic; we propose to synonomize Serraticardia with Corallina, transfer the type species S. maxima to Corallina (C. maxima (Yendo) comb. nov.), and describe the new genus Johansenia for S. macmillanii (J. macmillanii (Yendo) comb. nov.). Our molecular data also indicate that species in the genus Marginisporum have evolutionary affinities among species of Corallina and these genera should also be synonymized. This necessitates the combinations C. aberrans (Yendo) comb. nov. for M. aberrans (Yendo) Johansen & Chihara, C. crassissima (Yendo) comb. nov. for M. crassissimum (Yendo) Ganesan, and C. declinata (Yendo) comb. nov. for M. declinata (Yendo) Ganesan. Corallina elongata was divergent from all other members of Corallina and is transferred to a new genus, Ellisolandia (E. elongata (J. Ellis & Solander) comb. nov). In addition, COI-5P and internal transcribed spacer (ITS) data combined with morphological characters were used to establish that rather than the four Corallina species recognized in Canada, there are nine.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».