Exploring Deltorphin II Binding to the Third Extracellular Loop of the δ-Opioid Receptor
Notice bibliographique
Résumé
The third extracellular loop of the human delta-opioid receptor (hDOR) is known to play an important role in the binding of delta-selective ligands. In particular, mutation of three amino acids (Trp(284), Val(296), and Val(297)) to alanine significantly diminished delta-opioid receptor affinity for delta-selective ligands. To assess the changes in conformation accompanying binding of the endogenous opioid peptide deltorphin II to the delta-opioid receptor at both the receptor and ligand levels as well as to determine points of contact between the two, an in-depth spectroscopic study that addressed these points was initiated. Fragments of the delta-opioid receptor of variable length and containing residues in the third extracellular loop were synthesized and studied by NMR and CD spectroscopy in a membrane-mimetic milieu. The receptor peptides examined included hDOR-(279-299), hDOR-(283-299), hDOR-(281-297), and hDOR-(283-297). A helical conformation was observed for the longest receptor fragment between Val(283) and Arg(291), whereas a nascent helix occurred in a similar region for hDOR-(281-297). Further removal of N-terminal residues Val(281) and Ile(282) abolished helical conformation completely. Binding of the delta-selective ligand deltorphin II to hDOR-(279-299) destabilized the helix at the receptor peptide N terminus. Dramatic changes in the alpha-proton chemical shifts for Trp(284) and Leu(286) in hDOR-(279-299) also accompanied this loss of helical conformation. Large upfield displacement of alpha-proton chemical shifts was observed for Leu(295), Val(296), and Val(297) in hDOR-(279-299) following its interaction with deltorphin II, thus identifying a gain in beta-conformation at the receptor peptide C terminus. Similar changes did not occur for the shorter peptide hDOR(281-297). A hypothesis describing the conformational events accompanying selective deltorphin II binding to the delta-opioid receptor is presented.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».