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Enregistrement W2057856800 · doi:10.1016/s1672-0229(06)60020-x

Topological Properties of Protein-Protein and Metabolic Interaction Networks of <i>Drosophila Melanogaster</i>

2006· article· en· W2057856800 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueGenomics Proteomics & Bioinformatics · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBioinformatics and Genomic Networks
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDrosophila melanogasterTopology (electrical circuits)Computer sciencePath (computing)VitalityComputational biologyBiologyMathematicsGeneticsCombinatoricsComputer networkGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The underlying principle governing the natural phenomena of life is one of the critical issues receiving due importance in recent years. A key feature of the scale-free architecture is the vitality of the most connected nodes (hubs). The major objective of this article was to analyze the protein-protein and metabolic interaction networks of Drosophila melanogaster by considering the architectural patterns and the consequence of removal of hubs on the topological parameter of the two interaction systems. Analysis showed that both interaction networks follow a scale-free model, establishing the fact that most real world networks, from varied situations, conform to the small world pattern. The average path length showed a two-fold and a three-fold increase (changing from 9.42 to 20.93 and from 5.29 to 17.75, respectively) for the protein-protein and metabolic interaction networks, respectively, due to the deletion of hubs. On the contrary, the arbitrary elimination of nodes did not show any remarkable disparity in the topological parameter of the protein-protein and metabolic interaction networks (average path length: 9.42+/-0.02 and 5.27+/-0.01, respectively). This aberrant behavior for the two cases underscores the significance of the most linked nodes to the natural topology of the networks.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,040
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle