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Enregistrement W2057871932 · doi:10.1002/eji.200323143

Weak agonist self‐peptides promote selection and tuning of virus‐specific T cells

2003· article· en· W2057871932 sur OpenAlexaff
Samuel D. Saibil, Toshiaki Ohteki, Forest M. White, Mark A. Luscher, Arsen Zakarian, Alisha R. Elford, Jeffery Shabanowitz, Hiroshi Nishina, Patrice Hugo, Josef Penninger, Brian H. Barber, Donald F. Hunt, Pamela S. Ohashi

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Immunology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueT-cell and B-cell Immunology
Établissements canadiensUniversity Health NetworkUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Cancer InstituteU.S. Public Health Service
Mots-clésBiologyT-cell receptorPeptideNegative selectionCell biologyClonal deletionReceptorTransgeneMolecular biologyT cellImmunologyImmune systemBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent progress has begun to define the interactions and signaling pathways that are triggered during positive selection. To identify and further examine self-peptides that can mediate positive selection, we searched a protein-database to find peptides that have minimal homology with the viral peptide (p33) that activates a defined P14 transgenic TCR. We identified four peptides that could bind the restriction element H-2D(b) and induce proliferation of P14 transgenic splenocytes at high concentration. Two of the four peptides (DBM and RPP) were able to positively select the virus-specific TCR in fetal thymic organ culture but were unable to induce clonal deletion. Reverse-phase HPLC and mass spectrometry demonstrated that these peptides were presented by H-2D(b) molecules on thymic epithelial cell lines. We also examined whether the selecting ligands altered T cell responsiveness in vitro. DBM-selected T cells lost their ability to respond to the positively selecting ligand DBM, whereas RPP-selected T cells only retained their ability to respond to high concentrations of RPP. These results demonstrate that self-peptides that mediate positive selection can differentially "tune" the activation threshold of T cells and alter the functional repertoire of T cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,263
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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