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Enregistrement W2058084745 · doi:10.1016/j.jalz.2012.05.1257

P3‐039: Aβ binding properties of a synthetic peptide corresponding to an amino acid sequence in human pericentriolar material 1 (PCM‐1) protein

2012· article· en· W2058084745 sur OpenAlexaff
Balu Chakravarthy, Trevor Atkinson, Leslie Brown, Michel Ménard, Shingo Ito, James Whitfield

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématique14-3-3 protein interactions
Établissements canadiensNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMolecular biologyPeptide sequencePeptideBiochemistryAmino acidWestern blotBinding proteinPolyclonal antibodiesBiologyChemistryAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have isolated a ∼ 20kDa polypeptide (termed PK-4) from a T-7 Phage Display system expressing human brain cDNA library (Novagen) using polyclonal antibodies against a protein kinase C (PKC) inhibitor as bait. In addition to having PKC inhibitory activity, we serendipitously discovered that this polypeptide also bound Aß 1–42 with high affinity. The amino acid sequence of this polypeptide has 89 percent homology to an amino-acid sequence in human pericentriolar material-1 (PCM-1) protein. We have mapped the Aß-binding motif on this polypeptide, and have synthesized short (∼4 kDA; 40 amino acids) amyloid-binding peptides (ABPs) corresponding to this region. We have determined the Aß 1–42 binding properties of one of these ABPs, ABP-p4–5, using ELISA, dot blot and poly-acrylamide gel electrophoresis, and immunohistochemistry with brain sections. Cell toxicity assays were done with SH-SY5Y human neuroblastoma cells and Hoechst stain. We have found that ABP-p4–5 binds Aß 1–42 in the nM range. Thioflavin-binding assay and Western blot analysis indicate that ABP-p4–5 inhibits Aß 1–42 aggregation. Interestingly, ELISA studies indicated that ABP-p4–5 bound aggregated Aß1–42 preparations (37°C, 24 hrs) better than non-aggregated preparations, suggesting that it may have higher affinity towards Aß oligomers. In cell toxicity assays using human SH-SY5Y neuroblastoma cells, ABP-p4–5 inhibited Aß1–42-induced apoptotic cell death. Furthermore, we have found using fluorophore labeled p4–5 (FITC-p4–5) that it binds amyloid deposits in brain sections from Alzheimer's disease (AD)-transgenic mice and human AD patients in vitro and also when microinjected into AD-mouse brain. These results indicate that the ABP-p4–5 peptide can potentially be used therapeutically to reduce Aß burden and also to detect Aß deposits in the brain. Most importantly, since PCM-1 and the Aß 1–42-binding ABP-p4–5 have a high-sequence homology it would be interesting to determine whether PCM-1 has a role in the development of AD. Thus, for example, PCM-1 is known to be required for ciliogenesis which in turn is known to be required for neurogenesis and memory formation. So the question remains, would the accumulating oligomeric Aß 1–42 bind PCM-1 and prevent it from promoting ciliogenesis and supporting neurogenesis in an AD-developing brain?

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,909

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
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