MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2058138436 · doi:10.1508/cytologia.77.73

Nuclear-Encoded Plastid Sigma Factor SIG6 Exclusively Contributes to Chloroplast Differentiation in Plastid Differentiation of <i>Arabidopsis thaliana</i>

2012· article· en· W2058138436 sur OpenAlexaff
Shunsuke Hirooka, Mitsumasa Hanaoka, K. Enami, Takehiko Kanazawa, Toshiyuki Sone, Yuuta Imoto, Akikazu And, Haruko Kuroiwa, Tsuneyoshi Kuroiwa, Kan Tanaka

Notice bibliographique

RevueCYTOLOGIA · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensSaint Paul University
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of ScienceMinistry of Education, Culture, Sports, Science and Technology
Mots-clésPlastidAmyloplastBiologyChloroplastMutantArabidopsis thalianaGeneCell biologyArabidopsisNuclear geneGeneticsGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cells of land plants contain several kinds of plastids such as chloroplasts, etioplasts, proplastids, leucoplasts, and amyloplasts. Among them, the chloroplast, the most well characterized type of plastid, relies on expression of plastid-encoded photosynthetic genes. The genome of plastids encodes many photosynthetic genes that are mainly transcribed by the plastid-encoded plastid RNA polymerase (PEP). Transcriptional activity of PEP is controlled by nuclear-encoded sigma factors that are important for transcription initiation and promoter selectivity. Arabidopsis thaliana possesses 6 sigma factor genes, SIG1 to 6. Here, we analyzed the function of SIG6, a gene related to chloroplast differentiation. The null mutant (sig6-1) of the SIG6 gene exhibited a pale green phenotype in the cotyledons and in the basal part of emerging true leaves at early stages of development. Interestingly, as leaves matured, the color of cotyledons and true leaves changed to green. In the wild-type and sig6-1 mutant, plastids visualized by green fluorescent protein (GFP) were observed under the epifluorescence microscope. In cotyledons of 3-day-old seedlings, chloroplasts of the sig6-1 mutant showed small and irregular morphology compared with that of the wild-type chloroplasts. However, amyloplasts and leucoplasts in root tissues showed no obvious differences between the wild-type and the sig6-1 mutant. These results suggest that SIG6 plays a key role during the early stages of chloroplast differentiation, but not in differentiation into other types of plastids such as leucoplasts and amyloplasts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,119
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCYTOLOGIAMême sujetPhotosynthetic Processes and MechanismsTravaux en français237 207