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Enregistrement W2058200456 · doi:10.1158/1538-7445.fbcr13-c55

Abstract C55: Investigating mechanisms of gastrointestinal polyposis and osteoblastic tumor formation induced by mesenchymal Lkb1 deficiency

2013· article· en· W2058200456 sur OpenAlexaff
Kaisa Laajanen, Saara Ollila, Iris P.L. Wong, Kari Vaahtomeri, Gustavo Leone, Benoı̂t Viollet, Makela P. Tomi

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensCanadian Nautical Research Society
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMesenchymal stem cellCancer researchCarcinogenesisBiologyAMPKCancerCell biologyKinaseGeneticsProtein kinase A

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Lkb1 has emerged as an important tumor suppressor gene in both sporadic and hereditary cancer. Inactivating germline mutations in the LKB1 gene underlie familial Peutz-Jeghers Syndrome (PJS), a cancer-prone disorder characterized by predisposition to gastrointestinal polyposis. Targeted disruption of Lkb1 in mesenchymal smooth muscle cells was sufficient to recapitulate PJS-type polyposis in mice (Katajisto et al, 2008) and Lkb1 heterozygous mice develop osteoblastic tumors (Robinson et al, 2008). To investigate the mechanism(s) by which Lkb1 loss in mesenchymal tissues drives tumorigenesis, we deleted Lkb1 using two mesenchymal deletors (Fsp1-Cre and Twist2-Cre) expressed in mesenchymal progenitors. Heterozygous deletion of Lkb1 with either Fsp1-Cre (Lkb1flox/+;Fsp1-Cre) or Twist2-Cre (Lkb1flox/+;Twist2-Cre) results in both polyposis and osteoblastic tumor. Homozygous Lkb1 deletion using Fsp1-Cre (Lkb1flox/flox;Fsp1-Cre) leads to rapid polyposis and osteoblastic tumors with complete penetrance, indicating that complete loss of Lkb1 is advantageous for tumorigenesis. AMPK, a key substrate of Lkb1 connected to several other tumor suppressors, has been proposed to mediate Lkb1 tumor suppressive function. However, homozygous deletion of both AMPKα1 and AMPKα2 using Fsp1-Cre does not lead to tumorigenesis. These results implicate other Lkb1 substrate kinases in tumor suppression and suggest Lkb1 loss in a common progenitor underlies mesenchymal tumorigenesis. Katajisto P, et al., (2008) LKB1 signaling in mesenchymal cells required for suppression of gastrointestinal polyposis. Nat Genet, 40(4): p. 455-9 Robinson J, et al., (2008) Osteogenic tumours in Lkb1-deficient mice. Exp Mol Pathol, 85(3): p. 223-6 Citation Format: Kaisa Laajanen, Saara Ollila, Iris PL Wong, Kari Vaahtomeri, Gustavo Leone, Benoit Viollet, Makela P. Tomi. Investigating mechanisms of gastrointestinal polyposis and osteoblastic tumor formation induced by mesenchymal Lkb1 deficiency. [abstract]. In: Proceedings of the Third AACR International Conference on Frontiers in Basic Cancer Research; Sep 18-22, 2013; National Harbor, MD. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2013;73(19 Suppl):Abstract nr C55.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,072
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
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