MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2058259582 · doi:10.1021/bi992609m

Pyrene Excimer Fluorescence:  A Spatially Sensitive Probe To Monitor Lipid-Induced Helical Rearrangement of Apolipophorin III

2000· article· en· W2058259582 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Structure and Dynamics
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPyreneExcimerChemistryFluorescenceLimulusPhotochemistryCysteineBiophysicsMonomerMaleimideBiochemistryOrganic chemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Manduca sexta apolipophorin III (apoLp-III), an 18-kDa, monomeric, insect hemolymph apolipoprotein, is comprised of five amphipathic alpha-helices arranged as a globular bundle in the lipid-free state. Upon lipid binding, it is postulated that the bundle opens, exposing a continuous hydrophobic surface which becomes available for lipid interaction. To investigate lipid binding-induced helical rearrangements, we exploited the unique fluorescence characteristics of N-(1-pyrene)maleimide. Pyrene is a spatially sensitive extrinsic fluorescent probe, which forms excited-state dimers (excimers) upon close encounter with another pyrene molecule. Cysteine residues were introduced into apoLp-III (which otherwise lacks cysteine) at Asn 40 (helix 2) and/or Leu 90 (helix 3), creating two single-cysteine mutants (N40C-apoLp-III and L90C-apoLp-III) and N40C/L90C-apoLp-III, a double-cysteine mutant, which were labeled with pyrene maleimide. Pyrene-labeled N40C/L90C-apoLp-III, but not the pyrene-labeled single-cysteine mutants, exhibited strong excimer fluorescence in the lipid-free, monomeric state. Guanidine hydrochloride titration and temperature studies revealed a loss in excimer fluorescence, accompanied by a loss in the molar ellipticity of the protein. When apoLp-III interacts with phospholipid vesicles to form disklike complexes, a significant loss in excimer fluorescence was noted, indicating that the helices bearing the pyrene moieties diverge from each other. Pyrene excimer fluorescence was further employed to examine the relative orientation of lipid-bound apoLp-III molecules. Pyrene-labeled N40C- or L90C-apoLp-III displayed no excimer fluorescence in the disk complexes, while complexes prepared with an equal mixture of both single-labeled mutants did emit excimer fluorescence, indicating apoLp-III adopts a preferred nonrandom orientation around the perimeter of the bilayer disk. These studies establish pyrene excimer fluorescence as a useful spectroscopic tool to address intra- and intermolecular interactions of exchangeable apolipoproteins upon binding to lipid.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,987

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle