Identification of<i>Potato mop-top virus</i>(PMTV) in potatoes in China
Notice bibliographique
Résumé
Potato tubers exhibiting necrotic rings/arcs were found in a winter potato crop ‘Favorita’ in the subtropical area Huidong county, Guangdong province, China, in 2012. When the symptomatic tubers were cut crosswise, light to dark brown necrotic arcs were observed in the tuber flesh. A mini-survey of the crop found 8% symptomatic tubers in an area of 10 meters2. To reveal the causal agent of the disease, reverse transcription–polymerase chain reactions (RT-PCR) targeting 9 common potato viruses including those viruses (e.g, Potato mop-top virus (PMTV), Tobacco rattle virus, Tomato spotted wilt virus, and Potato virus Y tuber necrosis strain) known to be capable of induction of tuber necrosis, were carried out. Except for PMTV, no other viruses were detected. Sequencing of the 460 bp amplicon revealed that the fragment exhibited a 99-100% sequence identify with most PMTV coat protein sequences deposited in GenBank, which was confirmed by a further phylogenetic analysis. Enzyme linked immunosorbent assay with PMTV antibody on the symptomatic tubers was also carried out, and a positive reading was observed. Together, these results demonstrate that PMTV was the causal agent for the spraing disease in potatoes in the winter crop in Guangdong. To our knowledge, this is the first report of PMTV in Guangdong province, China, and the first scientific confirmation of PMTV in China.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».