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Enregistrement W2058326304 · doi:10.1074/jbc.m112.373365

Functional Importance of Dicer Protein in the Adaptive Cellular Response to Hypoxia

2012· article· en· W2058326304 sur OpenAlexafffund
Jacqueline Ho, Julie Metcalf, Matthew S. Yan, Paul J. Turgeon, Jenny Jing Wang, Maria Chalsev, Tania N. Petruzziello-Pellegrini, Albert K.Y. Tsui, Jeff He, Helena Dhamko, H. S. Jeffrey Man, G. Brett Robb, Bin Tean Teh, Michael Ohh, Philip A. Marsden

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensUniversity of TorontoSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésDicermicroRNACell biologyBiologyHypoxia (environmental)Gene silencingCellular adaptationHypoxia-inducible factorsRegulation of gene expressionHIF1ARNA interferenceAngiogenesisCancer researchGeneRNAChemistryGeneticsOxygen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The processes by which cells sense and respond to ambient oxygen concentration are fundamental to cell survival and function, and they commonly target gene regulatory events. To date, however, little is known about the link between the microRNA pathway and hypoxia signaling. Here, we show in vitro and in vivo that chronic hypoxia impairs Dicer (DICER1) expression and activity, resulting in global consequences on microRNA biogenesis. We show that von Hippel-Lindau-dependent down-regulation of Dicer is key to the expression and function of hypoxia-inducible factor α (HIF-α) subunits. Specifically, we show that EPAS1/HIF-2α is regulated by the Dicer-dependent microRNA miR-185, which is down-regulated by hypoxia. Full expression of hypoxia-responsive/HIF target genes in chronic hypoxia (e.g. VEGFA, FLT1/VEGFR1, KDR/VEGFR2, BNIP3L, and SLC2A1/GLUT1), the function of which is to regulate various adaptive responses to compromised oxygen availability, is also dependent on hypoxia-mediated down-regulation of Dicer function and changes in post-transcriptional gene regulation. Therefore, functional deficiency of Dicer in chronic hypoxia is relevant to both HIF-α isoforms and hypoxia-responsive/HIF target genes, especially in the vascular endothelium. These findings have relevance to emerging therapies given that we show that the efficacy of RNA interference under chronic hypoxia, but not normal oxygen availability, is Dicer-dependent. Collectively, these findings show that the down-regulation of Dicer under chronic hypoxia is an adaptive mechanism that serves to maintain the cellular hypoxic response through HIF-α- and microRNA-dependent mechanisms, thereby providing an essential mechanistic insight into the oxygen-dependent microRNA regulatory pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,110
Score d'incertitude au seuil0,237

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations162
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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