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Enregistrement W2058387866 · doi:10.1021/jp510497r

Effects of Cholesterol on the Thermodynamics and Kinetics of Passive Transport of Water through Lipid Membranes

2015· article· en· W2058387866 sur OpenAlexafffund
Bilkiss B. Issack, Gilles H. Peslherbe

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid Membrane Structure and Behavior
Établissements canadiensConcordia University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPermeationBilayerChemistryMembraneLipid bilayerCholesterolPermeability (electromagnetism)KineticsDiffusionMolecular dynamicsAnalytical Chemistry (journal)ThermodynamicsBiophysicsChromatographyBiochemistryComputational chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

While it has long been known that cholesterol reduces the permeability of biological membranes to water, the exact mechanism by which cholesterol influences transmembrane permeation is still unclear. The thermodynamic and kinetic contributions to the transport of water across mixed DPPC/cholesterol bilayers of different composition are thus examined by molecular dynamics simulations. Our analyses show that cholesterol decreases transmembrane permeability to water mainly by altering the thermodynamics of water transport. In particular, the free-energy barrier to permeation is magnified in the dense bilayer interior and the partitioning of water is significantly lowered. The changes are observed to correlate quantitatively well with the cholesterol-dependent density and thickness of the bilayers. In contrast, diffusion coefficients are relatively insensitive to cholesterol concentration, except in the sparsely populated center of the bilayer. Diffusion of water in cholesterol-containing bilayers appears to be related to changes in the free area in the middle of the bilayer and to the solute cross-sectional area in the denser hydrophobic regions. Overall, cholesterol is found to have an inhibitory effect on the permeation of water at all concentrations investigated, although bilayers containing cholesterol concentrations up to 20 mol % display a more dramatic dependence on cholesterol content than at higher concentrations. Our results show that it is possible to quantitatively reproduce the relative effects of cholesterol on lipid bilayer permeability from molecular dynamics simulations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,023

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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