Comparative Analysis of Six DNA Extraction Methods in Cowpea (Vigna unguiculata L.Walp)
Notice bibliographique
Résumé
High quality DNA extractions are a prerequisite for genetic studies of a variety of plants including cowpea (Vigna unguiculata). Nowadays, there are a great number of plant DNA extraction methods, and commercially available extraction kits are also becoming more and more popular. It appears that different procedures work best for different plant groups. Thus in the genetic studies of cowpea, which DNA extraction method to choose becomes a concern. To solve this problem, five classic plant DNA isolation methods, including three CTAB methods and two SDS methods, were compared and evaluated while isolation using a commercial kit was also undertaken. The DNA extracted by these six methods from two-week-old cowpea seedlings were analyzed according to their cost and time, yield, purity, integrity, and functionality in restriction endonuclease digestion and PCR (polymerase chain reaction) based downstream analysis. After the evaluation, one most suitable method, described by Dellaporta et al. (1983) was selected and chosen for isolating DNA from young leaves of cowpea seedlings. The cost and time required in this method was relatively low. In addition, the quantity and the quality of the DNA extracted by this method were high enough to perform hundreds of PCR-based reactions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,007 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».