dbCPCO: a database of genetic markers tested for their predictive and prognostic value in colorectal cancer
Notice bibliographique
Résumé
Colorectal cancer is the third most common cancer with a 5-year survival rate of 30-65%. A portion of the interpatient variability in its clinical outcome is attributed to inherited and somatic genetic factors. Although numerous research articles have investigated these factors in colorectal cancer, there has not been a central resource, such as a public database, that compiles these findings. Here we describe the dbCPCO, a database of genetic variations tested for association with colorectal cancer prognosis and clinical outcome. dbCPCO curates the results of research articles on colorectal cancer that investigate the possible correlation of genetic factors with various patient and tumor characteristics. Literature reports are retrieved from PubMed. The data that meet the inclusion criteria are compiled in a relational database and posted in a dedicated Website. The genetic factors include inherited genetic polymorphisms, and somatic and germline mutations in both nuclear and mitochondrial DNA. As of March 2010, the dbCPCO Website posts 778 scientific findings on 456 polymorphisms, somatic and germline mutations from 189 genes, and genetic loci tested for correlation with clinicopathological features and/or clinical outcome in colorectal cancer. The dbCPCO is periodically updated and freely available for the scientific and medical community at http://www.med.mun.ca/cpco.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».