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Enregistrement W2058526084 · doi:10.1002/mc.20686

Regulation of FGF‐2 by an endogenous antisense RNA: Effects on cell adhesion and cell‐cycle progression

2010· article· en· W2058526084 sur OpenAlexafffund
Leigh‐Ann MacFarlane, Paul R. Murphy

Notice bibliographique

RevueMolecular Carcinogenesis · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFibroblast Growth Factor Research
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésGene knockdownBiologySmall interfering RNACell cycleFibroblast growth factorAntisense RNACell adhesionCellCell growthDownregulation and upregulationCell biologyTransfectionMicroarray analysis techniquesCancer researchMolecular biologyApoptosisGene expressionCell cultureGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fibroblast growth factor (FGF-2) and its endogenous antisense RNA FGF antisense (FGF-AS) have been implicated in cancer progression and correlated with clinical outcomes of cancer patients. We previously reported that elevated FGF-AS expression is associated with reduced tumor recurrence and improved survival rates in patients with FGF-2-dependent esophageal adenocarcinoma. In the present study we examined the effect of siRNA knockdown of each transcript on the expression of its complementary partner RNA, and consequent changes in cellular phenotype and behavior. FGF-AS and FGF-2 were inversely expressed in a cell-cycle-dependent manner and siRNA-mediated knockdown of either FGF-AS or FGF-2 resulted in upregulation of the complementary transcript and protein. siRNA-mediated knockdown of FGF-AS was associated with a dramatic increase in cell-substratum adhesion and marked changes in the expression of a number of genes encoding adhesion molecules. Microarray analysis and RT-PCR analysis also revealed antithetical effects of FGF-2 and FGF-AS siRNA knockdown on the expression of a number of cell-cycle-related genes, including SKP2, SESTRIN-3, EIF4BP2, CDC27, and P190RhoGAP (P190). Cell-cycle analysis following siRNA-mediated knockdown of FGF-AS or FGF-2 indicate that both factors are involved in control of transition through the G₁ and G₂ boundaries, affecting cell-cycle progression, proliferation, and apoptosis. Finally, siRNA knockdown of FGF-AS resulted in a significant increase in invasion activity. These data indicate that regulatory interactions between FGF-AS and FGF-2 are involved in control of cell adhesion, cell-cycle progression, and invasion, providing a possible explanation for the protective effects of FGF-AS expression observed in FGF-2-dependent cancers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,951

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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