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Enregistrement W2058526501 · doi:10.1152/ajpcell.00054.2004

Changes in gene expression in gills of the euryhaline killifish <i>Fundulus heteroclitus</i> after abrupt salinity transfer

2004· article· en· W2058526501 sur OpenAlexaff
Graham R. Scott, Jeff G. Richards, Biff Forbush, Paul Isenring, Patricia M. Schulte

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Cell Physiology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePhysiological and biochemical adaptations
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases
Mots-clésKillifishEuryhalineFundulusGillBiologyOsmoregulationGene expressionCystic fibrosis transmembrane conductance regulatorIon transporterBiophysicsCell biologySalinityBiochemistryEcologyGeneFisheryMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Maintenance of ion balance requires that ionoregulatory epithelia modulate ion flux in response to internal or environmental osmotic challenges. We have explored the basis of this functional plasticity in the gills of the euryhaline killifish Fundulus heteroclitus. The expression patterns of several genes encoding ion transport proteins were quantified after transfer from near-isosmotic brackish water [10 parts/thousand (ppt)] to either freshwater (FW) or seawater (SW). Many changes in response to SW transfer were transient. Increased mRNA expression occurred 1 day after transfer for Na(+)-K(+)-ATPase-alpha(1a) (3-fold), Na(+)-K(+)-2Cl(-)-cotransporter 1 (NKCC1) (3-fold), and glucocorticoid receptor (1.3-fold) and was paralleled by elevated Na(+)-K(+)-ATPase activity (2-fold). The transient increase in NKCC1 mRNA expression was followed by a later 2-fold rise in NKCC protein abundance. In contrast to the other genes studied in the present work, mRNA expression of the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) Cl(-) channel generally remained elevated (2-fold) in SW. No change in protein abundance was detected, however, suggesting posttranscriptional regulation. The responses to FW transfer were quite different from those to SW transfer. In particular, FW transfer increased Na(+)-K(+)-ATPase-alpha(1a) mRNA expression and Na(+)-K(+)-ATPase activity to a greater extent than did SW transfer but had no effect on V-type H(+)-ATPase expression, supporting the current suggestion that killifish gills transport Na(+) via Na(+)/H(+) exchange. These findings demonstrate unique patterns of ion transporter expression in killifish gills after salinity transfer and illustrate important mechanisms of functional plasticity in ion-transporting epithelia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,379
Score d'incertitude au seuil0,605

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations240
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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