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Enregistrement W2058538079 · doi:10.1186/1471-2202-13-s1-o5

Experimentally constrained network model of hippocampal fast-firing parvalbumin-positive interneurons

2012· article· en· W2058538079 sur OpenAlexafffund
Katie Ferguson, Carey Y. L. Huh, Bénédicte Amilhon, Rosanah Murugesu, Sylvain Williams, Frances K. Skinner

Notice bibliographique

RevueBMC Neuroscience · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeural dynamics and brain function
Établissements canadiensUniversity of TorontoMcGill UniversityDouglas Mental Health University InstituteUniversity Health Network
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésExcitatory postsynaptic potentialNeuroscienceNetwork modelMembrane potentialBiological systemCurrent clampVoltage clampComputer scienceChemistryPhysicsBiologyInhibitory postsynaptic potentialArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Our PV+ interneurons are represented with an Izhikevich-type model [2], and involve parameter values that are designed to approximate the cell’ si ntrinsic properties. To determine these parameters, spike characteristics and passive properties were extracted from wholecell patch clamp recordings of PV+ interneurons in the CA1 region of an intact hippocampal preparation in vitro. Our network model is composed of these individual PV+ cell models, and the network size, architecture, and synaptic properties are chosen to be consistent with those found in the literature. Recordings during emergent network oscillations [3] provided us with information about realistic firing rates and synaptic activity of PV+ interneurons. These firing rates, used in combination with the cell’s intrinsic frequency-current profile, provided physiological constraints on the amount of synaptic current the PV+ cells receive during these spontaneous network oscillations. Under voltage clamp, excitatory post-synaptic current peaks are used in our model as an upper bound on the range of synaptic input. We used this network model to determine whether coherent rhythms could be produced within experimental constraints. Our model produced intrinsic properties and spiking behaviors which approximated the experimentally determined membrane capacitance, resting membrane potential, threshold potential, spike width, spike peak potential, peak after-hyperpolarizing potential, and amount of adaptation. Model parameters were determined such that the slope of the model’s frequency-current profile and the model rheobase current were within the range of our experimental data. As such, we have produced a network model of PV+ interneurons that has direct links to cellular characteristics with model parameters that have clear biological interpretations. In addition, network simulations of our PV+ interneuron model produced coherent gamma output. Since the firing properties and network architecture of PV+ interneurons puts them in an ideal position to influence network activity, this cell type will likely remain a focus of experimentalists and modelers alike. A model such as ours, with clear links to biology, may be used as a platform to investigate the role of these fast-firing PV+ interneurons in network oscillations and behaviour.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,395
Score d'incertitude au seuil0,920

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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