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Enregistrement W2058549408 · doi:10.1021/mp900030w

Identification, Expression, and Functional Characterization of Full-Length and Splice Variants of Murine Organic Anion Transporting Polypeptide 1b2

2009· article· en· W2058549408 sur OpenAlexafffund
Henriette E. Meyer zu Schwabedissen, Joseph A. Ware, Rommel G. Tirona, Richard B. Kim

Notice bibliographique

RevueMolecular Pharmaceutics · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensPfizer (Canada)Western University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésOrganic anion-transporting polypeptideOrganic anion transporter 1Complementary DNABiologyTransporterMolecular biologyMessenger RNAspliceSolute carrier familyHeterologous expressionAlternative splicingGeneBiochemistryChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The family of organic anion transporting polypeptides (OATPs) plays an important role in mediating the cellular uptake of numerous endogenous and exogenous compounds. Members of this family include human OATP1B1 and OATP1B3, which have been widely studied and shown to be involved in the hepatic uptake of hormones, bile acids, and many clinically used drugs. However, little is known about the murine orthologue, Oatp1b2. We determined expression of mouse oatp1b2 mRNA and protein using real-time PCR and Western blot analysis. Interestingly, mRNA transcripts and protein were detectable in a number of tissues including kidney and stomach, and, not surprisingly, the highest expression was noted in liver. Cloning of the full coding region of oatp1b2 revealed the presence of two novel splice variants. Interestingly, these splice variants were significantly expressed in organs such as the kidney, but much less in liver. Heterologous expression of the full-length Oatp1b2 cDNA revealed that taurocholic acid, estrone 3-sulfate, estradiol 17beta-glucuronide and pravastatin are substrates of this transporter. The newly identified splice variants were unable to significantly transport substrate compounds due to defects in cell surface trafficking. Our findings of murine Oatp1b2 expression and function will likely aid in better defining species related differences in OATP transporter function and the use of mouse models to predict hepatic drug disposition in humans.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,161
Score d'incertitude au seuil0,476

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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