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Enregistrement W2058776971 · doi:10.1021/bi061428z

Caspase 12 in Calnexin-Deficient Cells

2006· article· es· W2058776971 sur OpenAlexaff
Jody Groenendyk, Anna Zuppini, Gordon C. Shore, Michał Opas, R. Chris Bleackley, Marek Michalak

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2006
Typearticle
Languees
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversity of TorontoUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institutes of Health
Mots-clésCalnexinEndoplasmic reticulumCell biologyUnfolded protein responseThapsigarginCalreticulinApoptosisBiologyCaspase 3Cleavage (geology)Molecular biologyChemistryProgrammed cell deathBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We investigated a role for calnexin, caspase 12, and Bap31 in endoplasmic reticulum stress-induced apoptosis in calnexin-deficient mouse embryonic fibroblasts and a calnexin-deficient human T cell line (NKR). We showed that calnexin-deficient mouse embryonic fibroblasts are relatively resistant to endoplasmic reticulum stress-induced apoptosis. Western blot analysis demonstrated that both wild-type and calnexin-deficient cells contained a caspase 12 protein. Caspase 12 expression was slightly inhibited in calnexin-deficient cells, and the protein carried out specific cleavage in the presence of thapsigargin. Immunoprecipitation experiments revealed that in the endoplasmic reticulum, caspase 12 forms complexes with Bap31 and calnexin. Treatment of wild-type cells with thapsigargin induced apoptosis and cleavage of Bap31. However, in the absence of calnexin, there was no significant cleavage of Bap31. There was also a negligible processing of caspase 8 in these cells. This work indicates that calnexin may play a role in modulating the sensitivity of a cell to apoptosis induced by endoplasmic reticulum stress, in conjunction with caspase 12 and Bap31.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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