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Enregistrement W2058786551 · doi:10.1155/2012/785825

Toll-Like Receptor Transcriptome in the HPV-Positive Cervical Cancer Microenvironment

2011· article· en· W2058786551 sur OpenAlexafffund
Correne A. DeCarlo, Bruce A. Rosa, Robert Jackson, Sarah Niccoli, Nicholas Escott, Ingeborg Zehbe

Notice bibliographique

RevueClinical and Developmental Immunology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCervical Cancer and HPV Research
Établissements canadiensThunder Bay Regional Health Sciences CentreLakehead UniversityThunder Bay Regional Research Institute
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésCervical cancerTranscriptomeTumor microenvironmentToll-like receptorTollReceptorBiologyMedicineCancer researchComputational biologyCancerVirologyImmunologyInternal medicineGeneGeneticsInnate immune systemGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The human papillomavirus (HPV) directly infects cervical keratinocytes and interferes with TLR signalling. To shed light on the effect of HPV on upstream receptors, we evaluated TLRs 1-9 gene expression in HPV-negative normal and HPV-positive pre-malignant and malignant ex vivo cervical tissue. Quantitative real-time polymerase chain reaction was performed separately for epithelial and stromal tissue compartments. Differences in gene expression were analyzed by the Jonckheere-Terpstra trend test or the Student's t-test for pairwise comparison. Laser capture microdissection revealed an increase in TLR3 and a decrease in TLR1 mRNA levels in dysplastic and carcinoma epithelium, respectively. In the stroma, a trend of increasing TLR 1, 2, 5, 6, and 9 mRNA levels with disease severity was found. These findings implicate the involvement of TLR3 and TLR1 in early and late cervical carcinogenesis, respectively, suggesting that stromal upregulation of TLRs may play a role in cervical disease progression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,501
Score d'incertitude au seuil0,992

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,082
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations85
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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