The sodium channel gene family is specifically expressed in hen uterus and associated with eggshell quality traits
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Eggshell quality is important for the poultry industry. During eggshell formation a mass of inorganic minerals is deposited. The Sodium Channel (SCNN1) gene family plays an essential role in cation transportation. The objective of this study was to investigate the pattern of expression of members of the SCNN1 gene family, their variation and their effects on eggshell quality. RESULT: The highest expression of SCNN1a, SCNN1b, and SCNN1g genes were in the active uterus during eggshell mineralization, while SCNN1d showed its highest expression level in the quiescent uterus (no egg present). Nineteen candidate SNPs from the four genes were genotyped in a population of 338 White Leghorn layers. Association analysis between SNPs (haplotypes/diplotypes) and eggshell traits was performed. Among seven significant SNPs, five SNPs were associated with eggshell strength, eggshell thickness, eggshell percentage or/and egg weight, while the other two SNPs within SCNN1d were only associated with eggshell percentage. These SNPs had a 0.25-6.99% contribution to phenotypic variance, depending on the trait. In haplotype analysis, SCNN1b and SCNN1d were associated with egg weight. The SCNN1b and SCNN1g were significantly associated with eggshell weight while only SCNN1g explained 2.04% of phenotypic variance. All the alleles of the members of SCNN1 gene family were associated with eggshell percentage and eggshell thickness, and others members had an association with eggshell strength except for SCNN1a. The contribution of different haplotypes of the SCNN1 gene family to eggshell phenotypic variance ranged from 0.09% to 5.74%. CONCLUSIONS: Our study indicated that the SCNN1 gene family showed tissue expression specificity and was significantly associated with eggshell traits in chicken. This study provides evidence that genetic variation in members of the sodium channel can influence eggshell quality.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».