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Enregistrement W2058828496 · doi:10.1530/rep-09-0375

Proteomic comparison of detergent-extracted sperm proteins from bulls with different fertility indexes

2009· article· en· W2058828496 sur OpenAlexafffundabout
Olivier D’Amours, Gilles Frenette, Marlène Fortier, Pierre Leclerc, Robert Sullivan

Notice bibliographique

RevueReproduction · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSperm and Testicular Function
Établissements canadiensWilfrid Laurier UniversityUniversité LavalCentre hospitalier de l'Université Laval
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFonds Québécois de la Recherche sur la Nature et les Technologies
Mots-clésSpermFertilitySemenBiologyWestern blotAndrologyProteomeProtein subunitMolecular biologyBiochemistryGeneticsPopulationGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Intrinsic factors such as proteins modulate the fertilising ability of male gametes. We compared detergent-extracted sperm protein composition of bulls with different fertility indexes in order to highlight putative fertility markers of sperm. Frozen semen from 23 Holstein bulls with documented fertility was used. According to their 'fertility solution' (SOL), as calculated by the Canadian dairy network, bulls were divided into four groups: high fertility (HF) (SOL>3.0; n=6), medium-HF (2.9>SOL>2.0; n=5), medium-low fertility (-2.8>SOL>-4.9; n=8) and low fertility (LF; SOL<-5.0; n=4), with a SOL=0 being the average. Triton X-100 protein extracts from ejaculated spermatozoa were subjected to two-dimensional difference gel electrophoresis, and polypeptide maps were quantitatively analysed by ImageMaster software. Nine protein spots showed significant differences between the HF and LF groups, and eight of these proteins were identified by liquid chromatography-tandem mass spectrometry. T-complex protein 1 subunits epsilon and (CCT5 and CCT8), two isoforms of epididymal sperm-binding protein E12 (ELSPBP1), proteasome subunit alpha type-6 and binder of sperm 1 (BSP1) were more expressed in the LF group than in the HF group. On the other hand, adenylate kinase isoenzyme 1 (AK1) and phosphatidylethanolamine-binding protein 1 (PEBP1) were more expressed in the HF group than in the LF group. The presence and expression level of ELSPBP1, BSP1, AK1 and PEBP1 were confirmed by western blot. A linear regression model established that CCT5 and AK1 explained 64% (P<0.001) of the fertility scores. The reported functions of these proteins are in agreement with a putative involvement in defective sperm physiology, where lower or higher levels can jeopardise sperm ability to reach and fertilise the oocyte.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations178
Publié2009
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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