Fusions with histone H3 result in highly specific alteration of gene expression
Notice bibliographique
Résumé
Hap1 is a yeast transcriptional activator which controls expression of genes such as CYC1 and CYC7. Our results show that Hap1 activity is dependent on a functional chromatin remodeling complex SWI/SNF. Using a modified two-hybrid screen with Hap1 as bait, we recovered expression vectors encoding the Gal4 activation domain fused to histone H3 [Gal4(AD)-H3]. Hap1 activity at CYC1 or CYC7 was increased by Gal4(AD)-H3 and the effect was dependent on the presence of the activation domain of Hap1 and a functional SWI complex. Importantly, overexpression of H3 alone had no effect on Hap1 activity. Analysis of Gal4(AD)-H3 revealed that the fusion is not incorporated into the nucleosome while a functional Gal4 activation domain is dispensable. Activity of many other transcriptional activators was unchanged or slightly affected in the presence of Gal4(AD)-H3. Thus, our results identify a new class of histone H3 variants that cause highly specific alteration of gene expression. Hap1 may interact directly with H3 favoring chromatin remodeling by the SWI/SNF complex.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».