Significance of bacterivory and viral lysis in bottom waters of Franklin Bay, Canadian Arctic, during winter
Notice bibliographique
Résumé
Little information is currently available about water column microbial processes or mortality during Arctic winter.To address this paucity, we used epifluorescence microscopy and dilution experiments to determine the abundance of flagellates, bacteria and virus-like particles (VLP) and the rates of bacterial growth, bacterivory and virus-induced mortality in subzero-temperature bottom waters (≤ 230 m) of Franklin Bay during February and March 2004, when ice-covered surface waters were highly oligotrophic (maximum chlorophyll a value of 0.09 µg l -1 ).We focused on bottom waters due to the possible importance of sediment resuspension as a source of organic matter.While flagellates were present at low densities (1.5 to 3.1 × 10 2 ml -1 ), bacterial concentrations resembled those from other seasons in the region and increased over the 5 wk sampling period, from 1.4 × 10 5 to 3.0 × 10 5 ml -1 .VLPs were typically an order of magnitude more abundant than bacteria (range of 1.4 to 4.5 × 10 6 VLP ml -1 ) and, like the fraction of particle-associated bacteria (but not total bacteria), correlated with particulate organic carbon concentration (r s = 0.82, p < 0.04, n = 7).Grazing rates, whether measured in dilution experiments or calculated from flagellate abundance, were low or undetectable (maximum of -0.004 h -1 ).Of 3 parallel experiments, 2 yielded substantial virus-induced mortality (-0.006 to -0.015 h -1 ), comparable to or exceeding the intrinsic bacterial growth rate (0.010 h -1 in both experiments) and suggesting viruses were the more important agents of bacterial mortality under these conditions.Using a viral reduction approach, VLP production measured in the water column or ice-moored sediment traps was commonly low (0.3 to 7.7 × 10 4 VLP ml -1 h -1 ) or undetectable, highly variable among replicates and, when measurable, implied viral turnover times between 0.9 and 12 d.In general, our results show that, despite the oligotrophy of Arctic winter, bottom water bacterial communities can remain active and subject to viral predation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».