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Enregistrement W2058930402 · doi:10.3354/ame043209

Significance of bacterivory and viral lysis in bottom waters of Franklin Bay, Canadian Arctic, during winter

2006· article· en· W2058930402 sur OpenAlexaboutno aff
LE Wells, J. W. Deming

Notice bibliographique

RevueAquatic Microbial Ecology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueArctic and Antarctic ice dynamics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBayWater columnArcticChlorophyll aBacterioplanktonOceanographyEnvironmental sciencePhytoplanktonBacterivoreMicrobial population biologyAbundance (ecology)EcologyBiologyBacteriaNutrientBotanyGeology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Little information is currently available about water column microbial processes or mortality during Arctic winter.To address this paucity, we used epifluorescence microscopy and dilution experiments to determine the abundance of flagellates, bacteria and virus-like particles (VLP) and the rates of bacterial growth, bacterivory and virus-induced mortality in subzero-temperature bottom waters (≤ 230 m) of Franklin Bay during February and March 2004, when ice-covered surface waters were highly oligotrophic (maximum chlorophyll a value of 0.09 µg l -1 ).We focused on bottom waters due to the possible importance of sediment resuspension as a source of organic matter.While flagellates were present at low densities (1.5 to 3.1 × 10 2 ml -1 ), bacterial concentrations resembled those from other seasons in the region and increased over the 5 wk sampling period, from 1.4 × 10 5 to 3.0 × 10 5 ml -1 .VLPs were typically an order of magnitude more abundant than bacteria (range of 1.4 to 4.5 × 10 6 VLP ml -1 ) and, like the fraction of particle-associated bacteria (but not total bacteria), correlated with particulate organic carbon concentration (r s = 0.82, p < 0.04, n = 7).Grazing rates, whether measured in dilution experiments or calculated from flagellate abundance, were low or undetectable (maximum of -0.004 h -1 ).Of 3 parallel experiments, 2 yielded substantial virus-induced mortality (-0.006 to -0.015 h -1 ), comparable to or exceeding the intrinsic bacterial growth rate (0.010 h -1 in both experiments) and suggesting viruses were the more important agents of bacterial mortality under these conditions.Using a viral reduction approach, VLP production measured in the water column or ice-moored sediment traps was commonly low (0.3 to 7.7 × 10 4 VLP ml -1 h -1 ) or undetectable, highly variable among replicates and, when measurable, implied viral turnover times between 0.9 and 12 d.In general, our results show that, despite the oligotrophy of Arctic winter, bottom water bacterial communities can remain active and subject to viral predation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,097
Score d'incertitude au seuil0,196

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,165
Écart entre enseignants0,162 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations89
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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