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Enregistrement W2058980784 · doi:10.1158/0008-5472.sabcs-09-2017

Steroid Receptor RNA Activator Protein (SRAP): A Potential New Prognostic Marker for Estrogen Receptor-Positive/Node-Negative/Younger Breast Cancer Patients.

2009· article· en· W2058980784 sur OpenAlexaff
Yi Yan, G. Skliris, Carla Penner, Shilpa Chooniedass‐Kothari, C.D.O. Cooper, Z.J. Nugent, A. Fristenski, Mohammad K. Hamedani, Anne Blanchard, Yvonne Myal, Leigh C. Murphy, Etienne Leygue

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBreast cancerEstrogen receptorOncologyInternal medicineHazard ratioProportional hazards modelCancerProgesterone receptorTissue microarrayImmunohistochemistryMedicineEstrogenBiologyEndocrinologyConfidence interval

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Purpose: The steroid receptor RNA activator (SRA) is a functional RNA suspected to participate in the mechanisms underlying breast tumor progression. This RNA is also able to encode for a protein, SRAP, whose exact function remains to be determined. Our aim was to assess, in a large breast cancer cohort, whether levels of this protein could be associated with outcome or established clinical parameters.Experimental Design: Following antibody validation, we have assessed SRAP expression by tissue-microarray (TMA) analysis of 372 tumors with known steroid receptor and node status. Clinical follow-up was available for all the corresponding patients. Immunohistochemical scores were independently determined by two investigators and averaged. Statistical analyses were performed using standard univariate and multivariate tests.Results: SRAP levels were significantly (Mann-Whitney rank sum test, P<0.05) higher in estrogen receptor-alpha positive (ER+, n = 273), in progesterone receptor positive (PR+, n= 256) and in older patients (age ≥ 65 years, n = 183). When considering ER+ tumors, PR+ tumors, or young patients (< 65 years), patients with high SRAP expression had a significantly (Mantel-Cox test, P < 0.05) worse breast cancer specific survival (BCSS) than patients with low SRAP levels. SRAP also appeared as a very powerful indicator of poor prognostic for BCSS in the subset of ER+, node negative and young breast cancer patients (Cox regression analysis, n = 60, BCSS Hazard Ratio=13.937, P<0.0001).Conclusion: Our data suggest that SRAP might be a new predictor of breast cancer specific survival in younger breast cancer patients with ER+/node negative tumors. Citation Information: Cancer Res 2009;69(24 Suppl):Abstract nr 2017.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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