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Enregistrement W2059010644 · doi:10.1021/jo0057809

Efficient Preparation of Natural and Synthetic Galactosides with a Recombinant β-1,4-Galactosyltransferase-/UDP-4‘-Gal Epimerase Fusion Protein

2001· article· en· W2059010644 sur OpenAlexaff
Ola Blixt, Jillian R. Brown, M. Schur, Warren W. Wakarchuk, James C. Paulson

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Organic Chemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensInstitute for Biological Sciences
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Cancer Institute
Mots-clésGalactosidesRecombinant DNAGalactosyltransferaseFusion proteinFusionChemistryBiochemistryEnzymeGenePhilosophy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The numerous biological roles of LacNAc-based oligosaccharides have led to an increased demand for these structures for biological studies. In this report, an efficient route for the synthesis of beta-galactosides using a bacterial beta-4-galactosyltransferase/-UDP-4'-gal-epimerase fusion protein is described. The lgtB gene from Neisseria meningitidis and the galE gene from Streptococcus thermophilus were fused and cloned into an expression vector pCW. The fusion protein transfers galactose to a variety of different glucose- and glucosamine-containing acceptors, and utilizes either UDP-galactose or UDP-glucose as donor substrates. A crude lysate from Escherichia coli expressing the fusion protein is demonstrated to be sufficient for the efficient preparation of galactosylated oligosaccharides from inexpensive UDP-glucose in a multigram scale. Lysates containing the fusion protein are also found to be useful in the production of more complex oligosaccharides in coupled reaction mixtures, e.g., in the preparation of sialosides from N-acetylglucosamine. Thus, bacterially expressed fusion protein is well suited for the facile and economic preparation of natural oligosaccharides and synthetic derivatives based on the lactosamine core.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations68
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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