MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2059032889 · doi:10.1371/journal.pone.0104757

DNA Methylation Modifications Associated with Chronic Fatigue Syndrome

2014· article· en· W2059032889 sur OpenAlexaff
Wilfred C. de Vega, Suzanne D. Vernon, Patrick O. McGowan

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFibromyalgia and Chronic Fatigue Syndrome Research
Établissements canadiensUniversity of TorontoThe Scarborough Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChronic fatigue syndromeEpigeneticsDNA methylationBiologyImmune systemGeneGeneticsPopulationMethylationDifferentially methylated regionsImmunologyGene expressionMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chronic Fatigue Syndrome (CFS), also known as myalgic encephalomyelitis, is a complex multifactorial disease that is characterized by the persistent presence of fatigue and other particular symptoms for a minimum of 6 months. Symptoms fail to dissipate after sufficient rest and have major effects on the daily functioning of CFS sufferers. CFS is a multi-system disease with a heterogeneous patient population showing a wide variety of functional disabilities and its biological basis remains poorly understood. Stable alterations in gene function in the immune system have been reported in several studies of CFS. Epigenetic modifications have been implicated in long-term effects on gene function, however, to our knowledge, genome-wide epigenetic modifications associated with CFS have not been explored. We examined the DNA methylome in peripheral blood mononuclear cells isolated from CFS patients and healthy controls using the Illumina HumanMethylation450 BeadChip array, controlling for invariant probes and probes overlapping polymorphic sequences. Gene ontology (GO) and network analysis of differentially methylated genes was performed to determine potential biological pathways showing changes in DNA methylation in CFS. We found an increased abundance of differentially methylated genes related to the immune response, cellular metabolism, and kinase activity. Genes associated with immune cell regulation, the largest coordinated enrichment of differentially methylated pathways, showed hypomethylation within promoters and other gene regulatory elements in CFS. These data are consistent with evidence of multisystem dysregulation in CFS and implicate the involvement of DNA modifications in CFS pathology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,775
Score d'incertitude au seuil0,539

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,075
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations67
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS ONEMême sujetFibromyalgia and Chronic Fatigue Syndrome ResearchTravaux en français237 207