MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2059053985 · doi:10.1097/ccm.0b013e31827c072e

Determination of Burn Patient Outcome by Large-Scale Quantitative Discovery Proteomics

2013· article· en· W2059053985 sur OpenAlexaff
Celeste C. Finnerty, Marc G. Jeschke, Weijun Qian, Amit Kaushal, Wenzhong Xiao, Tao Liu, Ronald Moore, David Camp, Lyle L. Moldawer, Constance M. Elson, David Schoenfeld, Richard L. Gamelli, Nicole S. Gibran, Matthew B. Klein, Brett D. Arnoldo, Daniel G. Remick, Richard Smith, Ronald W. Davis, Ronald G. Tompkins, David N. Herndon

Notice bibliographique

RevueCritical Care Medicine · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBurn Injury Management and Outcomes
Établissements canadiensSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesOffice of International Science and EngineeringNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Center for Research ResourcesNational Institute of General Medical SciencesUniversity of Washington
Mots-clésMedicineProteomicsBiomarker discoveryBiomarkerProteomeBurn injuryTotal body surface areaAcute-phase proteinInflammationBioinformaticsInternal medicineSurgeryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: Emerging proteomics techniques can be used to establish proteomic outcome signatures and to identify candidate biomarkers for survival following traumatic injury. We applied high-resolution liquid chromatography-mass spectrometry and multiplex cytokine analysis to profile the plasma proteome of survivors and nonsurvivors of massive burn injury to determine the proteomic survival signature following a major burn injury. DESIGN: Proteomic discovery study. SETTING: Five burn hospitals across the United States. PATIENTS: Thirty-two burn patients (16 nonsurvivors and 16 survivors), 19-89 years old, were admitted within 96 hours of injury to the participating hospitals with burns covering more than 20% of the total body surface area and required at least one surgical intervention. INTERVENTIONS: None. MEASUREMENTS AND MAIN RESULTS: We found differences in circulating levels of 43 proteins involved in the acute-phase response, hepatic signaling, the complement cascade, inflammation, and insulin resistance. Thirty-two of the proteins identified were not previously known to play a role in the response to burn. Interleukin-4, interleukin-8, granulocyte macrophage colony-stimulating factor, monocyte chemotactic protein-1, and β2-microglobulin correlated well with survival and may serve as clinical biomarkers. CONCLUSIONS: These results demonstrate the utility of these techniques for establishing proteomic survival signatures and for use as a discovery tool to identify candidate biomarkers for survival. This is the first clinical application of a high-throughput, large-scale liquid chromatography-mass spectrometry-based quantitative plasma proteomic approach for biomarker discovery for the prediction of patient outcome following burn, trauma, or critical illness.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,372
Score d'incertitude au seuil0,537

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,339
Écart entre enseignants0,315 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCritical Care MedicineMême sujetBurn Injury Management and OutcomesTravaux en français237 207