Towards a phylogenetic nomenclature of <i>Tracheophyta</i>
Notice bibliographique
Résumé
Phylogenetic definitions are provided for the names of 53 clades of vascular plants. Emphasis has been placed on well‐supported clades that are widely known to non‐specialists and/or have a deep origin within Tracheophyta or Angiospermae . These treatments follow the draft PhyloCode and illustrate the application of phylogenetic nomenclature in a variety of nomenclatural and phylogenetic contexts. Phylogenetic nomenclature promotes precision in distinguishing crown, apomorphy‐based, and total clades, thereby improving communication about character evolution and divergence times. To make these distinctions more transparent without increasing the number of entirely different names that must be learned, the following naming conventions (which have been adopted in the most recent draft of the PhyloCode ) are employed here: widely known names are applied to crown clades, and the corresponding total clade (i.e., crown plus stem) is named “ Pan‐X ”, where “ X ” is the name of the crown (e.g., Pan‐Spermatophyta for the total clade of plants that share more recent ancestry with extant seed plants than with any other crown clade). If a name “ X ” that is based etymologically on an apomorphy is applied to the crown, the name “ Apo‐X ” is applied to the clade for which this trait is synapomorphic (e.g., Apo‐Spermatophyta for the clade originating from the first plant with seeds). Crown clade names can be defined by three kinds of definitions, two of which are used here: standard node‐based and branch‐modified node‐based. The latter is particularly useful when outgroup relationships of a crown clade are better known than basal relationships within the clade. Criteria and approaches used here to choose among competing preexisting names for a clade, to select a definition type, to choose appropriate specifiers, and (in some cases) to restrict the use of a name to certain phylogenetic contexts may be widely applicable when naming other clades. The phylogenetic definitions proposed here should help focus future discussions of the PhyloCode on real definitions rather than simplified hypothetical ones.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,008 | 0,010 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,006 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,005 |
| Communication savante | 0,007 | 0,008 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,009 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,008 | 0,009 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».