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Enregistrement W2059167714 · doi:10.5402/2012/492578

Detection of <i>PIK3CA</i> Mutations in Breast Cancer Bone Metastases

2012· article· en· W2059167714 sur OpenAlexafffund
Manijeh Daneshmand, Jennifer Hanson, Mitra Nabavi, John Hilton, Lisa Vandermeer, Femina Kanji, Susan Dent, Mark Clemons, Ian Lorimer

Notice bibliographique

RevueISRN Oncology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePI3K/AKT/mTOR signaling in cancer
Établissements canadiensUniversity of OttawaOttawa Hospital
Organismes subventionnairesOttawa Hospital Research Institute
Mots-clésMedicineBreast cancerCancerBone marrowMetastatic breast cancerOncologyPrimary tumorTrephineMutationInternal medicinePathologyMetastasisGeneBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background. An important goal of personalized cancer therapy is to tailor specific therapies to the mutational profile of individual patients. However, whole genome sequencing studies have shown that the mutational profiles of cancers evolve over time and often differ between primary and metastatic sites. Activating point mutations in the PIK3CA gene are common in primary breast cancer tumors, but their presence in breast cancer bone metastases has not been assessed previously. Results. Fourteen patients with breast cancer bone metastases were biopsied by three methods: CT-guided bone biopsies; bone marrow trephine biopsies; and bone marrow aspiration. Samples that were positive for cancer cells were obtained from six patients. Three of these patients had detectable PIK3CA mutations in bone marrow cancer cells. Primary tumor samples were available for four of the six patients assessed for PIK3CA status in their bone metastases. For each of these, the PIK3CA mutation status was the same in the primary and metastatic sites. Conclusions. PIK3CA mutations occur frequently in breast cancer bone metastases. The PIK3CA mutation status in bone metastases samples appears to reflect the PIK3CA mutation status in the primary tumour. Breast cancer patients with bone metastases may be candidates for treatment with selective PIK3CA inhibitors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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