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Enregistrement W2059315506 · doi:10.2174/138161212799315957

Identification and Validation of Hits from High Throughput Screens for CFTR Modulators

2012· review· en· W2059315506 sur OpenAlexafffund
Stan Pasyk, Steven V. Molinski, Wilson Yu, Paul D. W. Eckford, Christine E. Bear

Notice bibliographique

RevueCurrent Pharmaceutical Design · 2012
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésComputational biologyPopulationIn silicoCystic fibrosisHigh-throughput screeningIdentification (biology)CompendiumMutationBiologyBioinformaticsComputer scienceMedicineGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

These are exciting times with the appearance of small molecule compounds in clinical trials which target the basic defects caused by mutation in the CFTR gene. This progress was enabled by years of basic research probing the molecular and cellular consequences caused by mutation and the development of methods by which to study the primary anion transport defect in a high-throughput manner by robotics. Future progress with the development of new, more effective corrector compounds is needed. Such discovery will require further progress in defining the molecular targets for effective intervention using a multidisciplinary approach, merging computational, molecular, proteomic and cell biological methods. There is also an urgent need to develop means to link the right therapeutic compound to the right patients given the heterogeneity of the CF patient population. We envision a time when mid to high-throughput methods will be married with stem cell biology to enable testing a compendium of compounds on cells derived from each individual patient. Given the rate of progress in this field- this scenario may exist in the not too distant future. Keywords: High-throughput screening, in-silico screening, biological validation, selection of appropriate animal and cellular models, mutation, CFTR gene, CF patient population, Cystic fibrosis, ATP-Binding Cassette (ABC) Superfamily, airway

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,978
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,327
Tête enseignante GPT0,500
Écart entre enseignants0,173 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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