RelB deficiency causes combined immunodeficiency
Notice bibliographique
Résumé
Background: Combined immunodeficiency (CID) presents in infancy with severe microbial infections due to either the depletion or dysfunction of lymphocytes. Several mutated genes have been implicated in causing this condition. These encoded proteins are involved in gene recombination, signal transduction from receptors to transcription factors, or they are critical for lymphocyte development. There remain 20%–30% of patients with similar phenotypes but with no known genetic aberration. The objective of this study was to define the molecular basis of CID in a group of patients. Genotyping was performed using linkage panel chips, and the results were analyzed for parametric linkage. Whole genome sequencing was also performed. In vitro mitogen stimulation, flow cytometry, real time PCR, Western blotting, and cytokine ELISA were used to assess immunological status and signal transduction pathways. We identified a homozygous mutation in the gene for the NFκB transcription factor RelB in 3 patients who suffered repeated infection despite the presence of circulating T and B cells. This mutation introduces a premature stop, resulting in an ablation of RelB expression. Evaluation of patient immune systems revealed reduced response to mitogens and an inability to maintain an adequate antibody response to immunizations. Lack of RelB expression results in a clinical presentation of CID. Statement of novelty: We describe RelB deficiency for the first time.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».