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Enregistrement W2059396214 · doi:10.1158/1538-7445.am2012-4109

Abstract 4109: The unfolded protein response promotes tolerance to extreme hypoxia through autophagy dependent maintenance of cellular metabolism

2012· article· en· W2059396214 sur OpenAlexaff
Dan Cojocari, Aalim M. Weljie, Jing Wen, Kasper M.A. Rouschop, Ravi N. Vellanki, Marianne Koritzinsky, Bradly G. Wouters

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensUniversity of CalgaryOntario Institute for Cancer ResearchUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAutophagyATG5BiologyHypoxia (environmental)Cell biologyUnfolded protein responseProgrammed cell deathPI3K/AKT/mTOR pathwayHomeostasisCancer researchMechanistic target of rapamycinSignal transductionChemistryApoptosisBiochemistryEndoplasmic reticulum

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Oxygenation patterns in solid human tumors are highly heterogeneous both amongst and within tumors, and individual cells can be exposed to mild or extreme hypoxia. Hypoxia is known to influence the behavior of tumor cells in an adverse manner, resulting in poor response to radiotherapy, chemotherapy, and an increased metastatic capacity. The ability of cells to tolerate extreme hypoxia and the unusual metabolic environments found within tumors are not fully understood, but cell phenotype is influenced through at least three important oxygen-sensing pathways: HIF, mTOR and the unfolded protein response (UPR). Previously we have shown that the PERK-eIF2α arm of UPR, which is activated rapidly in response to extreme hypoxia, contributes to hypoxia tolerance in both cell lines and in human tumor xenografts. Furthermore, we found that signaling through PERK results in increased capacity for autophagy through direct transcriptional regulation of the autophagy genes ATG5 and LC3b during hypoxic exposure. We hypothesize that autophagy promotes survival during hypoxia through regulation of metabolic homeostasis and control of proteotoxicity. To elucidate the contribution of PERK signaling and autophagy to cell survival and metabolic homeostasis we created a series of isogenic cell lines with inducible expression of transgenes that cause PERK or autophagy signaling deficiency. We analyzed the changes in metabolism and in global metabolite levels during exposure to extreme hypoxia in wild type, PERK deficient, and autophagy deficient variants. Using liquid chromatography mass spectrometry, we identified a series of metabolites whose concentration varied in a time-dependent manner during hypoxia. Importantly, we found that cells defective in PERK signaling decreased levels of amino acids, increased fatty acids and evidence of oxidative stress products. Both, PERK signaling and autophagy deficiency resulted in accelerated glucose metabolism as evidenced by increased consumption and lactate production during hypoxia compared to controls. Together, these results suggest that PERK-dependent regulation of autophagy contributes to maintenance of bio-energetic status, preventing increased glucose flux and production of reactive oxygen species. Our data also demonstrate that aggressive, therapy resistant hypoxic cells may be selectively targeted by therapies that exploit the dependency of these cells on autophagy for survival. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 103rd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2012 Mar 31-Apr 4; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2012;72(8 Suppl):Abstract nr 4109. doi:1538-7445.AM2012-4109

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,346
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
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