Structure of the Periplasmic Stress Response Protein CpxP
Notice bibliographique
Résumé
CpxP is a novel bacterial periplasmic protein with no homologues of known function. In gram-negative enteric bacteria, CpxP is thought to interact with the two-component sensor kinase, CpxA, to inhibit induction of the Cpx envelope stress response in the absence of protein misfolding. CpxP has also been shown to facilitate DegP-mediated proteolysis of misfolded proteins. Six mutations that negate the ability of CpxP to function as a signaling protein are localized in or near two conserved LTXXQ motifs that define a class of proteins with similarity to CpxP, Pfam PF07813. To gain insight into how these mutations might affect CpxP signaling and/or proteolytic adaptor functions, the crystal structure of CpxP from Escherichia coli was determined to 2.85-Å resolution. The structure revealed an antiparallel dimer of intertwined α-helices with a highly basic concave surface. Each protomer consists of a long, hooked and bent hairpin fold, with the conserved LTXXQ motifs forming two diverging turns at one end. Biochemical studies demonstrated that CpxP maintains a dimeric state but may undergo a slight structural adjustment in response to the inducing cue, alkaline pH. Three of the six previously characterized cpxP loss-of-function mutations, M59T, Q55P, and Q128H, likely result from a destabilization of the protein fold, whereas the R60Q, D61E, and D61V mutations may alter intermolecular interactions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».