Phylogenetic Diversity of <i>Rhizoctonia solani</i> Associated with Canola and Wheat in Alberta, Manitoba, and Saskatchewan
Notice bibliographique
Résumé
Rhizoctonia solani is a damaging soilborne pathogen, which affects most field crops in the Canadian provinces of Alberta, Manitoba, and Saskatchewan. The objective of this study was to conduct a phylogenetic comparison of isolates of R. solani collected from a previous survey in the major canola- and wheat-growing regions of western Canada. A total of 128 multinucleate isolates from a previous survey were identified by internal transcribed spacer (ITS) sequence and compared to anastomosis group (AG) results. The multinucleate isolates of R. solani were grouped into eight distinct clades. Each clade corresponded to a specific AG with the exception of two distinct clades that were observed for isolates classified as AG 2-1 by anastomosis testing. While most isolates of AG 5 clustered together according to ITS sequences, three isolates classified by anastomosis grouping as AG 5 grouped with AG 2-1, AG 4, and a binucleate Rhizoctonia sp. in the phylogenetic analysis. In most instances, the results from AG tests were consistent with ITS sequence, but there were still several cases where isolates were inconsistently classified or failed to undergo anastomosis with any of the tester strains used in this study. This provides support for the use of the ITS region as a valuable tool for rapid identification of R. solani isolates to their respective AGs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».