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Enregistrement W2059613292 · doi:10.1074/jbc.m113.482505

Identification of a Region within the Placental Alkaline Phosphatase mRNA That Mediates p180-dependent Targeting to the Endoplasmic Reticulum

2013· article· en· W2059613292 sur OpenAlexaff
Xianying A. Cui, Yangjing Zhang, Seo Jung Hong, Alexander F. Palazzo

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlkaline Phosphatase Research Studies
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEndoplasmic reticulumPlacental alkaline phosphataseMessenger RNARNATranslation (biology)Alkaline phosphataseCell biologyBiologyMolecular biologyMembrane proteinChemistryBiochemistryMembraneGeneEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In both eukaryotic and prokaryotic cells, it has been recently established that mRNAs encoding secreted and membrane proteins can be localized to the surface of membranes via both translation-dependent and RNA element-mediated mechanisms. Previously, we showed that the placental alkaline phosphatase ( ALPP ) mRNA can be localized to the ER membrane independently of translation, and this localization is mediated by p180, an mRNA receptor present in the ER. In this article, we aimed to identify the cis -acting RNA element in ALPP . Using chimera constructs containing fragments of the ALPP mRNA, we demonstrate that the ER-localizing RNA element is present within the 3′ end of the open reading frame and codes for a transmembrane domain. In addition, we show that this region requires p180 for efficient ER anchoring. Taken together, we provide the first insight into the nature of cis- acting ER-localizing RNA elements responsible for localizing mRNAs on the ER in mammalian cells. Background: Certain mRNAs are anchored to the endoplasmic reticulum (ER) by p180. Results: The placental alkaline phosphatase mRNA requires its transmembrane domain coding region to be anchored by p180. Conclusion: Translational-independent ER targeting of mRNA by p180 can be mediated by regions of the ORF that encode hydrophobic peptides. Significance: Translational-independent targeting of mRNA to membranes may be mediated by a mechanism conserved between prokaryotes and eukaryotes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,328

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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