The influence of temperature and osmolyte on the catalytic cycle of cytochrome <i>c</i> oxidase
Notice bibliographique
Résumé
The influence of temperature on cytochrome c oxidase (CCO) catalytic activity was studied in the temperature range 240-308 K. Temperatures below 273 K required the inclusion of the osmolyte ethylene glycol. For steady-state activity between 278 and 308 K the activation energy was 12 kcal x mol-1; the molecular activity or turnover number was 12 s-1 at 280 K in the absence of ethylene glycol. CCO activity was studied between 240 and 277 K in the presence of ethylene glycol. The activation energy was 30 kcal x mol-1; the molecular activity was 1 s-1 at 280 K. Ethylene glycol inhibits CCO by lowering the activity of water. The rate limitation in electron transfer (ET) was not associated with ET into the CCO as cytochrome a was predominantly reduced in the aerobic steady state. The activity of CCO in flash-induced oxidation experiments was studied in the low temperature range in the presence of ethylene glycol. Flash photolysis of the reduced CO complex in the presence of oxygen resulted in three discernable processes. At 273 K the rate constants were 1500 s-1, 150 s-1 and 30 s-1 and these dropped to 220 s-1, 27 s-1 and 3 s-1 at 240 K. The activation energies were 5 kcal.mol-1, 7 kcal.mol-1, and 8 kcal.mol-1, respectively. The fastest rate we ascribe to the oxidation of cytochrome a3, the intermediate rate to cytochrome a oxidation and the slowest rate to the re-reduction of cytochrome a followed by its oxidation. There are two comparisons that are important: (a). with vs. without ethylene glycol and (b). steady state vs. flash-induced oxidation. When one makes these two comparisons it is clear that the CCO only senses the presence of osmolyte during the reductive portion of the catalytic cycle. In the present work that would mean after a flash-induced oxidation and the start of the next reduction/oxidation cycle.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».