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Enregistrement W2059711427 · doi:10.1044/1059-0889(2013/13-0018)

X-Linked Deafness-2 (DFNX2) Phenotype Associated With a Paracentric Inversion Upstream of <i>POU3F4</i>

2014· article· en· W2059711427 sur OpenAlexaff
G Anger, Susan Crocker, Kyle McKenzie, Kerry K. Brown, Cynthia C. Morton, Karen J. Harrison, Jennifer MacKenzie

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Audiology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueHearing, Cochlea, Tinnitus, Genetics
Établissements canadiensIzaak Walton Killam Health CentreDalhousie UniversityKingston General HospitalQueen's University
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical Sciences
Mots-clésPhenotypeAudiologyMedicineHearing lossGeneticsBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: The authors report on a 7-year-old male, designated FR, who has severe sensorineural hearing loss. Features include a round face, hypertelorism, epicanthal folds, and flat nasal root. Although there were early developmental concerns regarding FR, all but his speech delay resolved when he was placed in an educational program that accommodated his hearing loss. Genetic studies were performed to investigate genetic causes for his hearing loss. METHOD: History, physical examination, audiologic assessment, and imaging were performed according to usual practice. FMR1,GJB2,GJB6, and POU3F4 genes were sequenced. Chromosomal studies consisted of karyotyping and breakpoint analysis by fluorescence in situ hybridization (FISH). RESULTS: Results from FMR1,GJB2,GJB6, and POU3F4 sequencing and echocardiography, electrocardiogram, and abdominal ultrasound were normal. A computed tomography (CT) scan revealed a large fundus of the internal auditory canals and absence of the bony partition between the fundus and the adjacent cochlear turns, with a widened modiolus bilaterally. FR's CT findings were consistent with those described in persons with X-linked deafness-2 (DFNX2) hereditary deafness. FR's karyotype was 46,inv(X)(q13q24),Y.ish inv(X)(XIST+)mat. FISH refined the breakpoints to inv(X)(q21.1q22.3). The Xq21.1 breakpoint was narrowed to a 25-kb region 450 kb centromeric to the DFNX2 gene, POU3F4. There are rare case reports of DFNX2 patients with chromosomal rearrangements positioned centromeric to POU3F4 and no mutations within the gene. CONCLUSION: Authors hypothesized that FR's hearing loss was caused by dysregulation of POU3F4 due to separation from regulatory elements affected by the inversion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,107
Score d'incertitude au seuil0,636

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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