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Metabolic cross-talk allows labeling of O-linked β- <i>N</i> -acetylglucosamine-modified proteins via the <i>N</i> -acetylgalactosamine salvage pathway

2011· article· en· 356 citations· W2059725389 sur OpenAlex· 10.1073/pnas.1010045108

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Organisme subventionnaire canadienUn organisme canadien l'a financé. Le travail peut ne porter aucune affiliation canadienne.

Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Scores machine (provisoires)

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants
0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Résumé

Hundreds of mammalian nuclear and cytoplasmic proteins are reversibly glycosylated by O-linked β-N-acetylglucosamine (O-GlcNAc) to regulate their function, localization, and stability. Despite its broad functional significance, the dynamic and posttranslational nature of O-GlcNAc signaling makes it challenging to study using traditional molecular and cell biological techniques alone. Here, we report that metabolic cross-talk between the N-acetylgalactosamine salvage and O-GlcNAcylation pathways can be exploited for the tagging and identification of O-GlcNAcylated proteins. We found that N-azidoacetylgalactosamine (GalNAz) is converted by endogenous mammalian biosynthetic enzymes to UDP-GalNAz and then epimerized to UDP-N-azidoacetylglucosamine (GlcNAz). O-GlcNAc transferase accepts UDP-GlcNAz as a nucleotide-sugar donor, appending an azidosugar onto its native substrates, which can then be detected by covalent labeling using azide-reactive chemical probes. In a proof-of-principle proteomics experiment, we used metabolic GalNAz labeling of human cells and a bioorthogonal chemical probe to affinity-purify and identify numerous O-GlcNAcylated proteins. Our work provides a blueprint for a wide variety of future chemical approaches to identify, visualize, and characterize dynamic O-GlcNAc signaling.

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La notice

Revue
Proceedings of the National Academy of Sciences
Thématique
Glycosylation and Glycoproteins Research
Domaine
Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
Établissements canadiens
Organismes subventionnaires
National Institute of General Medical SciencesNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthSimon Fraser UniversityHoward Hughes Medical InstituteNational Defense Science and Engineering GraduateLife Sciences Research FoundationU.S. Department of Defense
Mots-clés
Bioorthogonal chemistryBiochemistryN-AcetylglucosamineChemistryMetabolic pathwayProteomicsEnzymeCovalent bondNucleotide sugarGlycosyltransferaseAcetylglucosamineGlycosylationClick chemistryCombinatorial chemistry
Résumé présent dans OpenAlex
oui