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Enregistrement W2059731376 · doi:10.1080/17482960801934403

Evaluation of the Golgi trafficking protein VPS54 (<i>wobbler</i>) as a candidate for ALS

2008· article· de· W2059731376 sur OpenAlexaff
Miriam H. Meisler, Carsten Russ, Kate Montgomery, Matthew Greenway, Sean Ennis, Orla Hardiman, Denise A. Figlewicz, Nicole R. Quenneville, Elizabeth Conibear, Robert H. Brown

Notice bibliographique

RevueAmyotrophic Lateral Sclerosis · 2008
Typearticle
Languede
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMissense mutationAmyotrophic lateral sclerosisGeneSingle-nucleotide polymorphismGeneticsExonBiologyMutationGolgi apparatusDiseaseMedicineInternal medicineGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

VPS54 is a component of the Golgi-associated retrograde protein (GARP) complex of vesicle sorting proteins. A missense mutation of Vps54 is responsible for motor neuron disease in the wobbler mouse, but the human gene on chromosome 2p14-15 has not been evaluated as a disease gene. We completely sequenced the 22 coding exons from 96 individuals with sporadic ALS, 96 individuals with familial ALS, and 96 controls. Twenty-one novel SNPs were identified. The non-synonymous variant, T360A, was observed in one patient and 0/910 controls. Several polymorphic non-synonymous SNPs were also observed in patients and controls. These initial data suggest that mutations in VPS54 are not a major cause of ALS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,765
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,089
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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