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Enregistrement W2059744785 · doi:10.3354/ame01183

Diversity of algal viruses in various North American freshwater environments

2008· article· en· W2059744785 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueAquatic Microbial Ecology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesUniversity of TorontoUniversity of Toronto MississaugaColorado Department of Natural ResourcesUniversity of Denver
Mots-clésPhylogenetic treeBiologyPhylogenetic diversityPhylogeneticsGenetic diversityEcologySpecies richnessRarefaction (ecology)GenusDNA sequencingBiodiversityZoologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To examine algal virus (Phycodnaviridae) genetic diversity in freshwater environments, gene fragments were cloned and sequenced from a river and a reservoir in Colorado, USA, and 2 different lakes in Ontario, Canada using PCR methods that target a diverse subset of known Phycodnaviridae DNA polymerase genes. Numerous phycodnavirus gene sequences were obtained from every sample, and rarefaction analysis of the sequence libraries demonstrated that virus richness was variable among different sample locations, and among samples collected from the same location at different times. Phylogenetic analysis of the unique sequences from each sample indicated that most sequences from the same geographic region (i.e. Colorado or Ontario) clustered together, but several exceptions were also observed. Phylogenetic analysis also demonstrated that the sequences obtained were more closely related to sequences from cultivated marine phycodnaviruses belonging to the genus Prasinovirus than to those from cultivated freshwater phycodnaviruses from the genus Chlorovirus. Overall, phycodnavirus sequences originating from cultivated marine viruses and marine clone libraries were not genetically distinct from the freshwater phycodnavirus sequences reported in this study.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,352
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle