MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2059990327 · doi:10.2135/cropsci2011.05.0267

Mapping and Quantitative Trait Loci Analysis of Drought Tolerance in a Spring Wheat Population Using Amplified Fragment Length Polymorphism and Diversity Array Technology Markers

2011· article· en· W2059990327 sur OpenAlexaff
Lauren M. Alexander, Francis M. Kirigwi, Allan K. Fritz, John P. Fellers

Notice bibliographique

RevueCrop Science · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensSyngenta (Canada)
Organismes subventionnairesNational Institute for Materials ScienceAgricultural Research ServiceKansas Wheat Commission
Mots-clésBiologyAmplified fragment length polymorphismQuantitative trait locusGeneticsLocus (genetics)MicrosatellitePopulationGenetic markerMolecular markerGenetic linkageDrought toleranceAlleleGenetic diversityBotanyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Water availability is commonly the most limiting factor for crop production. This study was conducted to map wheat (Triticum aestivum L.) quantitative trait loci (QTL) involved in drought tolerance. Using amplified fragment length polymorphisms (AFLPs) and Diversity Array Technology (DArT) markers, a population of 122 F7–derived recombinant inbred lines from a cross between ‘Dharwar Dry’ and ‘Sitta’ was reanalyzed to identify previously unknown QTL associated with drought tolerance traits and to further saturate known QTL regions. A linkage map of 48 groups was created from the combined data of DArT, AFLP, and previously reported simple sequence repeat (SSR) and expressed sequence tag (EST) markers. Quantitative trait loci were found in 24 of the 48 groups. Groups could be anchored on chromosomes 1D, 2B, 3A, 3B, 4A, 4B, 5A, 5B, 6A, 6D, 7A, and 7B. While four additional AFLP markers were added to the major QTL for drought tolerance on chromosome 4AL, a second major locus was found on chromosome 7B. QDt.ksu‐7B spans 34.7 cM with three associated markers. Simple sequence repeat marker Xbarc172 and DArT marker XwPt‐4230 explained 11.9% of the variation for harvest index under reduced irrigation in 1999 while AFLP marker XGTGG284 explained 10.7%. XwPt‐6463 explained 11.9 and 11.2% of the variation for drought susceptibility index for spike number and yield, respectively. The locus QDt.ksu‐4A now spans 21.9 cM and AFLP marker XCCGA110 explained 27.8 and 39.9% of the variation for grain fill rate and yield under reduced irrigation in 1999, respectively.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCrop ScienceMême sujetWheat and Barley Genetics and PathologyTravaux en français237 207