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Enregistrement W2060003537 · doi:10.1371/journal.pone.0084411

Identification of Mutations in Distinct Regions of p85 Alpha in Urothelial Cancer

2013· article· en· W2060003537 sur OpenAlexafffund
Rebecca L. Ross, Julie E. Burns, Claire Taylor, Paul Mellor, Deborah H. Anderson, Margaret A. Knowles

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePI3K/AKT/mTOR signaling in cancer
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanSaskatchewan Cancer Agency
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of LeedsSaskatchewan Health Research Foundation
Mots-clésP110αPTENMutantBiologyMutationCancer researchPleckstrin homology domainProtein kinase domainPI3K/AKT/mTOR pathwayGeneProtein kinase BMolecular biologyGeneticsPhosphorylationSignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bladder cancers commonly show genetic aberrations in the phosphatidylinositol 3-kinase signaling pathway. Here we have screened for mutations in PIK3R1, which encodes p85α, one of the regulatory subunits of PI3K. Two hundred and sixty-four bladder tumours and 41 bladder tumour cell lines were screened and 18 mutations were detected. Thirteen mutations were in C-terminal domains and are predicted to interfere with the interaction between p85α and p110α. Five mutations were in the BH domain of PIK3R1. This region has been implicated in p110α-independent roles of p85α, such as binding to and altering the activities of PTEN, Rab4 and Rab5. Expression of these mutant BH-p85α forms in mouse embryonic fibroblasts with p85α knockout indicated that all forms, except the truncation mutants, could bind and stabilize p110α but did not increase AKT phosphorylation, suggesting that BH mutations function independently of p110α. In a panel of 44 bladder tumour cell lines, 80% had reduced PIK3R1 mRNA expression relative to normal urothelial cells. This, along with mutation of PIK3R1, may alter BH domain functioning. Our findings suggest that mutant forms of p85α may play an oncogenic role in bladder cancer, not only via loss of ability to regulate p110α but also via altered function of the BH domain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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