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Enregistrement W2060079516 · doi:10.1097/fpc.0b013e328336ef1c

Extensive splicing of transcripts encoding the bile acid-conjugating enzyme UGT2B4 modulates glucuronidation

2010· article· en· W2060079516 sur OpenAlexafffund
Éric Lévesque, Vincent Ménard, Isabelle Laverdière, Judith Bellemare, Olivier Barbier, Hugo Girard, Chantal Guillemette

Notice bibliographique

RevuePharmacogenetics and Genomics · 2010
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacogenetics and Drug Metabolism
Établissements canadiensCentre hospitalier de l'Université LavalUniversité LavalCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada Research Chairs
Mots-clésExonBiologyGlucuronidationAlternative splicingGeneRNA splicingGene isoformMolecular biologyGeneticsBiochemistryEnzymeRNAMicrosome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND AIMS: UGT2B4 is a member of the UDP-glucuronosyltransferase (UGT) superfamily, a major detoxifying system in humans. UGT2B4 is involved in bile acids metabolism and highly expressed in liver and extrahepatic tissues. The aim of this study was to uncover new molecular mechanisms underlying interindividual variability in the UGT2B4 pathway. METHODS: We carried out a comprehensive scan for additional exons at this locus and discovered multiple alternative splicing events. We then assessed the expression profile of alternatively spliced transcripts in human tissues and the activity of the corresponding overexpressed proteins toward bile acids. RESULTS: We discovered three previously unidentified UGT2B4 exons, increasing the total known gene length to 46 kb. Molecular analyses revealed at least eight distinct mRNAs produced by (i) alternative promoter usage, (ii) complete and partial exon skipping, and (iii) use of alternative 3' splice sites. These splice variants were predominantly expressed in liver, gastrointestinal tract, and other extrahepatic tissues. Quantitative analyses of splicing events further sustain their prevalence in the liver. UGT2B4 proteins produced from these mRNA variants had undetectable transferase activity in human cells. However, when stably co-expressed with the active UGT2B4 isoform 1, three newly identified UGT2B4 isoforms (i2, i3, and i5) were found to negatively regulate glucuronidation. CONCLUSION: In addition to heritable genetic mutations and control of gene expression, the newly discovered diversity of UGT2B4 mRNAs may introduce variability in this glucuronidation pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,094
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,068
Tête enseignante GPT0,380
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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