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Enregistrement W2060105093 · doi:10.2174/1389202033490402

Trafficking of HIV-1 RNA: Recent Progress Involving Host Cell RNABinding Proteins

2003· article· en· W2060105093 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueCurrent Genomics · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensJewish General HospitalMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRNABiologyRNA splicingEctopic expressionRNA-binding proteinCell biologyGene expressionComputational biologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

RNA trafficking within the cell represents an important component of gene expression in a variety of organisms. This process directs RNA to select regions of the cell and has functional consequences to cell physiology and function. Intranuclear RNA trafficking can also influence RNA maturation including 5- and 3-end-processing, splicing and nuclear export. Within the cytosol, RNA trafficking influences the localization and levels of gene expression of the protein product to prevent ectopic expression, for example. For most cellular RNAs this process usually depends on an accurate and precisely timed sequence of events where each step depends on that which precedes it, usually initiated by the specific binding of trans-acting proteins to cognate RNA cis sequences to dictate their fate. This is also true for retroviral RNAs (see below). Human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) is a major affliction of the 21st century and it is estimated that more than 45 million people worldwide are infected. Although no cure is available, regimented antiviral drug therapy has become the golden standard for care. Accompanied with lifestyle changes both can not only bring virus to near undetectable levels but can also dramatically increase the lifespan and maintain a quality of life for a person living with the virus. As an intracellular parasite HIV-1 uses host cell proteins and machinery in most -if not all- of its replication steps including viral entry, integration, transcription and viral assembly. The understanding of their involvement in these steps will contribute in the treatment and perhaps the eventual eradication of HIV-1 infection. For this -the next generation of HIV-1 therapeutics- we will require a profound understanding of the biological role of these factors and, specifically, how they interact with the virus. This information will eventually lead to the development of specific inhibitors, which will likely be used in combination with existing retroviral therapeutic approaches. This review serves to update the reader on particular aspects of nucleocytoplasmic trafficking of HIV-1 RNAs involving HIV-1 Rev, Gag and associated host cell co-factors. It will update the reader on the current body of knowledge on host and viral proteins and mechanisms involved in the movement of HIV-1 RNAs out of the nucleus, within the cytosol and eventually to the sites of viral assembly. The novelty will be in its examination of the recent developments that implicate cellular RNA-binding proteins involved in HIV-1 RNA localization and cytosolic RNA trafficking. It is expected that host cell proteins and viral proteins will ultimately prove to be critical for these late steps of the viral lifecycle. Keywords: hiv-1 rna, rna-binding protein, hiv trafficking, rna trafficking, hiv-1 rev

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,324
Score d'incertitude au seuil0,799

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle