MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2060146432 · doi:10.1074/jbc.m603354200

Of Two Cytosolic Aconitases Expressed in Drosophila, Only One Functions as an Iron-regulatory Protein

2006· article· en· W2060146432 sur OpenAlexaff
Maria Lind, Fanis Missirlis, Öjar Melefors, Helge Uhrigshardt, Kim Kirby, J. P. Phillips, Kenneth Söderhäll, Tracey A. Rouault

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueIron Metabolism and Disorders
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNational Institutes of Health
Mots-clésInternal ribosome entry siteAconitaseDrosophila melanogasterBiologyCaenorhabditis elegansCell biologyGeneCytosolGeneticsTranslation (biology)BiochemistryMitochondrionMessenger RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In mammalian cells, iron homeostasis is largely regulated by post-transcriptional control of gene expression through the binding of iron-regulatory proteins (IRP1 and IRP2) to iron-responsive elements (IREs) contained in the untranslated regions of target mRNAs. IRP2 is the dominant iron sensor in mammalian cells under normoxia, but IRP1 is the more ancient protein in evolutionary terms and has an additional function as a cytosolic aconitase. The Caenorhabditis elegans genome does not contain an IRP2 homolog or identifiable IREs; its IRP1 homolog has aconitase activity but does not bind to mammalian IREs. The Drosophila genome offers an evolutionary intermediate containing two IRP1-like proteins (IRP-1A and IRP-1B) and target genes with IREs. Here, we used purified recombinant IRP-1A and IRP-1B from Drosophila melanogaster and showed that only IRP-1A can bind to IREs, although both proteins possess aconitase activity. These results were also corroborated in whole-fly homogenates from transgenic flies that overexpress IRP-1A and IRP-1B in their fat bodies. Ubiquitous and muscle-specific overexpression of IRP-1A, but not of IRP-1B, resulted in pre-adult lethality, underscoring the importance of the biochemical difference between the two proteins. Domain-swap experiments showed that multiple amino acid substitutions scattered throughout the IRP1 domains are synergistically required for conferring IRE binding activity. Our data suggest that as a first step during the evolution of the IRP/IRE system, the ancient cytosolic aconitase was duplicated in insects with one variant acquiring IRE-specific binding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations61
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetIron Metabolism and DisordersTravaux en français237 207