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Enregistrement W2060371289 · doi:10.1002/cyto.b.20450

Kinetics of H2AX phosphorylation after exposure to cisplatin

2008· article· en· W2060371289 sur OpenAlexaff
Peggy L. Olive, Judit P. Banáth

Notice bibliographique

RevueCytometry Part B Clinical Cytometry · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensOccupational Cancer Research CentreBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCisplatinClonogenic assayComet assayDNA damageDNA repairChemistryCell cultureCellViability assayCancer researchDNAMolecular biologyBiologyBiochemistryChemotherapyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Cisplatin is a widely used cancer chemotherapeutic drug that causes DNA crosslinking and stimulates H2AX phosphorylation. Our goal was to assess the potential of gammaH2AX to help predict tumor response to cisplatin treatment. METHODS: The kinetics of cisplatin-induced DNA interstrand crosslinks was measured using the alkaline comet assay and compared with gammaH2AX formation and clonogenic cell survival in several DNA repair proficient or deficient human and rodent cell lines. RESULTS: The comet assay was effective in ranking cell lines according to their relative sensitivity to cisplatin based on reduced crosslink formation measured 6 h after drug exposure or by the failure of irs3 and UV41 cell lines to subsequently remove crosslinks. In comparison, the initial rate of phosphorylation of H2AX measured over the first 6 h after cisplatin treatment was unrelated to drug sensitivity or crosslinking proficiency. However, for proliferating cell cultures, the fraction of cells that retained gammaH2AX foci 24 h after cisplatin treatment was correlated with the fraction of cells that lost clonogenic potential (slope = 1.1, r(2) = 0.85). CONCLUSIONS: H2AX phosphorylation occurs in response to replication fork damage caused by cisplatin induced DNA lesions, probably interstrand crosslinks. Although early kinetics of gammaH2AX formation was uninformative, retention of gammaH2AX foci 24 h after treatment was shown to be a useful indicator of cell response to killing by cisplatin. However, for gammaH2AX to serve as an indicator of cell viability after cisplatin treatment, cells must have the opportunity to transit S phase during the recovery period.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations176
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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