Structural characterization of Haemophilus parainfluenzae lipooligosaccharide and elucidation of its role in adherence using an outer core mutant
Notice bibliographique
Résumé
The opportunistic pathogen Haemophilus parainfluenzae is a gram-negative bacterium found in the oropharynx of humans. Haemophilus parainfluenzae is a member of the Pasteurellaceae family in which it is most closely related to Haemophilus sengis and Actinobacillus. Characterization of surface displayed lipooligosaccharide has identified components that are crucial in adherence. We examined the oligosaccharide structure of lipooligosaccharide from 2 clinical isolates of H. parainfluenzae. Core oligosaccharide was isolated by standard methods from purified lipooligosaccharide. Structural information was established by a combination of monosaccharide and methylation analyses, nuclear magnetic resonance spectroscopy, and mass spectrometry revealing the following structures: R-(1-6)-beta-Glc-(1-4)-D,D-alpha-Hep-(1-6)-beta-Glc-(1-4)- substituting a tri-heptose-Kdo inner core of L,D-alpha-Hep-(1-2)-L,D-alpha-Hep-(1-3)-L,D-alpha-Hep-(1-5)-alpha-Kdo at the 4-position of the proximal L,D-alpha-Hep residue to Kdo, and with a PEtn residue at the 6-position of the central L,D-alpha-Hep residue. In strain 4282, the R substituent is beta-galactose and in strain 4201 there is no substituent at the distal glucose. These analyses have revealed that multiple structural aspects of H. parainfluenzae lipooligosaccharide are comparable with nontypeable Haemophilus influenzae lipooligosaccharide. This study also identified a galactan in strain 4201 and a glucan in strain 4282. Haemophilus parainfluenzae was shown to adhere to a bronchial epithelial cell line to the same degree as nontypeable H. influenzae. However, an H. parainfluenzae mutant lacking the outer core of the lipooligosaccharide showed diminished adherence to the epithelial cells, suggesting that H. parainfluenzae lipooligosaccharide plays a role in tissue colonization.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».