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Enregistrement W2060386995 · doi:10.1021/bi010077f

Latent Specificity of Molecular Recognition in Sodium Channels Engineered To Discriminate between Two “Indistinguishable” μ-Conotoxins

2001· article· en· W2060386995 sur OpenAlexaff
Ronald A. Li, Irene L. Ennis, Gordon F. Tomaselli, Robert J. French, Eduardo Marbán

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNicotinic Acetylcholine Receptors Study
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood Institute
Mots-clésConotoxinSodium channelChemistryMutantBiophysicsGene isoformToxinWild typeStereochemistryBiochemistrySodiumBiologyPeptideGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

mu-Conotoxins (mu-CTX) are potent oligopeptide blockers of sodium channels. The best characterized forms of mu-CTX, GIIIA and GIIIB, have similar primary and three-dimensional structures and comparable potencies (IC(50) approximately 30 nM) for block of wild-type skeletal muscle Na(+) channels. The two toxins are thus considered to be indistinguishable by their target channels. We have found mutations in the domain II pore region (D762K and E765K) that decrease GIIIB blocking affinity approximately 200-fold, but reduce GIIIA affinity by only approximately 4-fold, compared with wild-type channels. Synthetic mu-CTX GIIIA mutants reveal that the critical residue for differential recognition is at position 14, the site of the only charge difference between the two toxin isoforms. Therefore, engineered Na(+) channels, but not wild-type channels, can discriminate between two highly homologous conotoxins. Latent specificity of toxin-channel interactions, such as that revealed here, is a principle worthy of exploitation in the design and construction of improved biosensors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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