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Enregistrement W2060570337 · doi:10.1089/thy.2010.1642

The Canadian Pharmacogenomics Network for Drug Safety: A Model for Safety Pharmacology

2010· review· en· W2060570337 sur OpenAlexaffabout
Colin J.D. Ross, Henk Visscher, Johanna Sistonen, Liam R. Brunham, Kusala Pussegoda, Tenneille Loo, Michael J. Rieder, Gideon Koren, Bruce Carleton, Michael R. Hayden

Notice bibliographique

RevueThyroid · 2010
Typereview
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacogenetics and Drug Metabolism
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaHospital for Sick ChildrenSickKids FoundationBC Children's HospitalChild and Family Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPharmacogenomicsDrugSafety pharmacologyMedicinePharmacologyIntensive care medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Adverse drug reactions (ADRs) rank as one of the top 10 leading causes of death in the developed world, and the direct medical costs of ADRs exceed $100 billion annually in the United States alone. Pharmacogenomics research seeks to identify genetic factors that are responsible for individual differences in drug efficacy and susceptibility to ADRs. This has led to several genetic tests that are currently being used to provide clinical recommendations. The Canadian Pharmacogenomics Network for Drug Safety is a nation-wide effort established in Canada to identify novel predictive genomic markers of severe ADRs in children and adults. A surveillance network has been established in 17 of Canada's major hospitals to identify patients experiencing specific ADRs and to collect biological samples and relevant clinical history for genetic association studies. To identify ADR-associated genetic markers that could be incorporated into predictive tests that will reduce the occurrence of serious ADRs, high-throughput genomic analyses are conducted with samples from patients that have suffered serious ADRs and matched control patients. SUMMARY: ADRs represent a significant unmet medical problem with significant morbidity and mortality, and Canadian Pharmacogenomics Network for Drug Safety is a nation-wide network in Canada that seeks to identify genetic factors responsible for interindividual differences in susceptibility to serious ADRs. CONCLUSIONS: Active ADR surveillance is necessary to identify and recruit patients who suffer from serious ADRs. National and international collaborations are required to recruit sufficient patients for these studies. Several pharmacogenomics tests are currently in clinical use to provide dosing recommendations, and the number of pharmacogenomics tests is expected to significantly increase in the future.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,032
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,056
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,951
Score d'incertitude au seuil0,616

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0320,056
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0050,009
Études des sciences et des technologies0,0070,007
Communication savante0,0120,007
Science ouverte0,0060,006
Intégrité de la recherche0,0070,007
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0190,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,143
Tête enseignante GPT0,456
Écart entre enseignants0,314 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations83
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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