Photo-control of peptide conformation on a timescale of seconds with a conformationally constrained, blue-absorbing, photo-switchable linker
Notice bibliographique
Résumé
Azobenzene derivatives can be used to reversibly photo-regulate conformation and activity when introduced as intramolecular bridges in peptides and proteins. Here we report the design, synthesis, and characterization of an azobenzene derivative that absorbs between 400-450 nm in aqueous solution to produce the cis isomer, and relaxes back to the trans isomer with a half-life of a few seconds at room temperature. In the trans form, the linker can span a distance of approximately 25 A, so that it can bridge Cys residues spaced i, i + 15 in an alpha-helix. Switching of the azobenzene cross-linker from trans to cis causes a decrease in the helix content of peptides where the linker is attached via Cys residues spaced at i, i + 15 and i, i + 14 positions, no change in helix content with Cys residues spaced i, i + 11 and an increase in helix content in a peptide with Cys residues spaced at i, i + 7. In the presence of 10 mM reduced glutathione, the azobenzene cross-linker continued to photo-switch after 24 hours. This cross-linker design thus expands the possibilities for fast photo-control of peptide and protein structure in biochemical systems.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».